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直播精华丨汤一苇:新冠病毒核酸混样筛查的机遇和挑战

2020-05-27 18:47
来源:澎湃新闻·澎湃号·湃客
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原创 汤一苇 SIFIC感染官微 来自专辑全球抗疫,SIFIC在行动!

新冠病毒疫情在全球多国暴发,防控形势各有不同,应对策略也千差万别,而国内“外防输入,内防反弹”的策略始终不能放松,复工复产复医的紧迫形势又给疫情防控提出了更大挑战。SIFIC作为中国最大的感控-感染学术团体,发挥所长,全新打造了一个国内国际专家抗疫经验分享交流的平台,为世界公共卫生安全贡献力量。

“全球抗疫,SIFIC在行动”直播专栏为大家推出第二季,新平台,新形式,新体验,每周一期,我们将继续邀请国内/国际知名专家在线分享、交流与互动,紧扣抗疫热点问题,与您探讨策略最新变化。

目前,全国新冠肺炎疫情形势总体稳定,但“外防输入、内防反弹”压力持续加大,尤其是近期吉林、武汉发生了聚集性疫情,为科学应对无症状感染者带来的感染传播隐患,做好常态化、精准化防控,国家对各医疗机构开展新冠病毒检测能力提出了更高要求,核酸检测力度在不断加大。

核酸筛查,面临着怎样的机遇和挑战?疫情发展至今,对于新冠检测,我们积累了更多临床证据,这些最新循证依据对检测工作有着怎样的启发?一些重点地区、重点场所开展了人群核酸普查,在此情况下,我们该如何正确理解核酸检测、抗体检测在临床诊疗和疫情防控中的价值?

周六晚19:00-21:00,SIFIC邀请了汤一苇教授、蒋荣猛教授、张文宏教授、胡必杰教授、高晓东主任、缪青医生和我们一起分享和讨论关于新冠检测的热点话题。

讲者:汤一苇(美籍华人临床微生物学会主席)

整理:雷晓婷(江苏省中医院)/吴怀英

审核:吴怀英(聊城市第三人民医院)

来源:SIFIC全球抗疫 我们在行动

关于新冠病毒感染目前最重要的话题就是核酸检测,武汉千万人检测,这么大的检测样本下,不得不思考检测新冠病毒核酸、抗体、混样筛查、成本效益、价值等方方面面的问题,混样检测的有哪些优点?如何采样?如何检测?来自临床微生物学会主席——美籍华人汤一苇教授给大家详解。

防控新冠病毒传播的策略

保持1.5-2米社交距离,戴口罩,追踪接触史,密切接触者隔离观察,限制旅行。要甄别哪些人需要追踪、隔离、限制,离不开新冠病毒检测。在大量人群中开展检测,方法学上有一些要求:能满足短时间内大量人份;检测方法准确,特异性和灵敏度好;快速、减少等待时间;保证检测人员安全;能够实时云连接报告检测结果,为防控决策提供依据。

关于混样检测

混样检测依据:既往HIV病毒混样检测的经验可以为此问题提供借鉴。

混样检测:将10个待测样本混合为一个小池,再将9个小池混合成一个大池,检测大池样本;如发现阳性结果,再回溯检测相应小池,直至发现阳性样本。混样检测减少了检测次数,只需要22次检测就可筛查270个标本。

HIV混样检测与新冠病毒混样检测区别:新冠病毒的混样检测与HIV检测有所区别。HIV的急性感染率低,而新冠病毒的急性感染率不详,不同地区间存在差异。HIV急性感染期标本的病毒载量高,而新冠病毒载量相对较低,混样不能过多,过多灵敏度就不够了。HIV检测标本为血浆、血清,误差小;而新冠病毒标本为口咽、鼻咽拭子甚至唾液,标本质控难度较大。方法学方面,HIV试剂盒灵敏度高,而新冠病毒试剂盒研发时间短、优化不足,准确性不定。不同品牌试剂本身、收集标本的材料、拭子、病毒保存液也有区别。检测实验室生物安全级别亦有不同。

表1:混样筛查HIV-1与SARS-CoV-2的异同

参数

HIV-1急性感染

SARS-CoV-2携带

流行率

不详、地区之间有差异

病毒载量

低或中等

样本类型

标准(血浆、血清)

多样(鼻咽拭子、唾液)

方法学准确性

可靠

不详

试剂盒及材料

来源充足

不详、地区之间有差异

生物安全要求

BSL-2级

BSL-2级以上

采样方法

样本类型为鼻咽拭子时:要求一根柔软植绒鼻咽拭子,1毫升转移液,双侧鼻孔采样,采样前清洁鼻腔。

样本类型为清痰后唾液的要求(深部清痰唾液标本):可自我收集,与普通口水不同;是清痰后深部的痰与口水混合物;收集方法简单,过程不到2分钟;收集后标本可在室温保存数天。灵敏度不比鼻咽拭子差。

核酸检测的方法

北京某公司产品:分三个步骤——核酸提取、等温扩增、芯片检测;检测全程时间1.5小时;优点还可检测A/B流感病毒,呼吸道合胞病毒,需要专用仪器。

实时荧光PCR方法:国内绝大多数是这种方法。核酸提取后,进入扩增与检测过程,封闭系统。需要三个房间的设施。对实验室生物安全要求较高。全程4-6小时不等。

组群检测:提取、扩增与检测在同一系统中进行,没有污染和假阳性的问题。如BD MAX系统,还有美国、法国等检测系统 ,除检测新冠外,还可检测其它呼吸道病原体。1-3小时不等。

现场检测系统:全封闭系统,操作简单,非专业人员可操作。如亚雅 ID NOW和赛沛Xpert系统。检测时间15-45分钟不等,随到随测。

某检测产品系统案例介绍:

4月8号-5月11号在国内某机场,使用3家经国家相关部门批准的试剂进行新冠病毒筛检。4月24日检出一个样本阳性,追踪发现该携带者有68名密切接触者与196个一般接触者,带来巨大防控管理工作量。5月3日起,使用 Xpert Xpress assay试剂盒以10比1混样筛查。5月5日发现第一个阳性病例,2小时内在机场完成所有检测,后续仅需要将携带者转送至医院隔离观察。5月6日再次发现一例阳性,经CDC使用其它2种试剂复核,仍为阳性。

混样检测的优点

该新冠核酸病毒检测试剂的特点是可10:1混样完成大量检测;小于100 copies/ml可以检测到,准确性好。快速:45分钟完成检测。安全:全封闭系统,一次加样。结果:上传云端,实时报告,管理部门实时接收。

互动话题

问题1:我们有患者病情较重高度怀疑新冠肺炎,但是反复检测核酸阴性,肺部及临床症状较重,后来肺泡灌洗液核酸检测弱阳性,是不是病毒RT-PCR检测某个核苷发生变异或灵敏度降低?

汤一苇教授:有以下几种可能性。

第一,炎症症状不一定与病毒载量成正比,可能症状重时,病毒载量已经下降;第二,与标本采集时间、过程及质控可能有问题,特别是上呼吸道标本采集时质量不一定掌握好;第三,突变的可能性不大,因为核酸检测都是两个以上靶点,很少是单个靶点的,两个靶点其中一个靶点是特异性的,另一个靶点ß属间保守序列比较好,不大可能造成假阴性结果。

问题2:口咽拭子与鼻咽拭子阳性率差别很大,报道差别在20%左右,试剂盒质量固然很重要,但是鼻咽拭子普及率低,在阳性率检测方面有什么建议?

汤一苇教授:三点很重要。

第一,立即停止病毒标本灭活处理,因为病毒载量低的标本产生假阴性率很高;第二,尽量不用口咽拭子,因为很难质控;第三,香港经验,尽量尽快采用深部清痰的唾液标本(耐受性好),代替口咽、鼻咽拭子。

蒋荣猛教授:其实流感病毒采样也是一样首选鼻咽拭子,因为呼吸道病毒在不同部位、不同的感染时间病毒载量分布是不样的。基于筛查和诊断的意义是不一样的,百分百准确也不现实,会允许误差存在,但要求全流程都要做质控。

张文宏教授:口咽拭子、鼻咽拭子在病毒载量高时差别不大,筛查鼻咽拭子优于口咽拭子,但是鼻咽拭子被筛查人耐受性差。目前上海筛查采用口咽拭子也没有漏掉多少患者,也没有造成不良后果,现在武汉大规模检测,需要对结果进行循证医学分析口咽拭子与鼻咽拭子阳性率的差别。

胡必杰教授:建议研发生产柔软耐受性好的采样棉签,因为采样效果好,阳性率就高。

小结

汤一苇教授从检验的角度为大家分享了混样检测的方法、优缺点、采样的要求,并为大家分享了深部清痰唾液标本的采集方法,不用医务人员自己就可采集,此方法采集标本时耐受性好,期望在核酸筛查时尽快使用。

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