竹子基因图谱新进展：毛竹泛基因组发布

2024年9月15日，国际竹藤中心联合澳大利亚默多克大学的研究团队在《Nature Communications》期刊发表了题为“Haplotype-based pangenomes reveal genetic variations and climate adaptations in moso bamboo populations”的研究论文。该研究基于单倍型泛基因组，探讨了毛竹对当地气候的适应机制，并为应对气候变化提供了基因资源。本项目得到了国际竹藤组织试点成员国以竹代塑关键技术研究与示范项目（点击查看）等项目联合资助。

图：文章截图

毛竹是一种具有重要生态和经济价值的森林资源，在固碳和减缓气候变化方面发挥着重要作用。然而，气候变化的加剧威胁着毛竹的生存。该论文以毛竹为研究对象，为16个具有代表性的毛竹品种生成了基于单倍型的高质量泛基因组组装。基于单倍型的泛基因组显示毛竹主要是单倍型之间的变异，而非种内的变异。发现许多具有等位基因特异表达模式的基因与环境适应有关。通过整合时空气候数据，发现了与温度和降水等关键气候因子相关的多种变异，并进一步预测了在未来排放情景下毛竹主产区北部和西部地区遗传风险的增加，凸显了气温上升带来的威胁。该研究不仅为毛竹的保护和可持续利用提供了重要的基因组资源，也为其他重要的竹类和禾本科植物的气候适应研究提供了参考。

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原标题：《竹子基因图谱新进展：毛竹泛基因组发布》

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