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无需Cas9,不用载体递送,RNA编辑“瞄准器”实现体内持久高效RNA编辑

2022-03-16 07:04
来源:澎湃新闻·澎湃号·湃客
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原创 生物世界 生物世界 收录于话题 #新型基因编辑工具 13个

撰文 | nagashi

编辑 | 王多鱼

排版 | 水成文

遗传疾病的治疗一直是一个亟待解决的难题。所幸,随着人类基因组学的发展,科学家们意识到通过改变遗传病患者的基因序列——将突变的基因重新纠正,就能从根本上治愈人类遗传病。

近年来,可编程的、特定位点的基因编辑工具的开发,为纠正致病基因突变创造了机会,例如刘如谦(David Liu)等开发的DNA碱基编辑器。但针对DNA的编辑可能诱发可遗传的、永久性的脱靶突变,这极大地限制了DNA碱基编辑器在人体内的应用。相比之下,针对mRNA的RNA编辑只会改变瞬时改变mRNA,从而绕过安全和伦理问题。

近日,美国 Wave Life Sciences 公司在 Nature 子刊 Nature Biotechnology 上发表了题为:Endogenous ADAR-mediated RNA editing in non-human primates using stereopure chemically modified oligonucleotides 的研究论文。

这项研究发布了Wave Life Sciences最新的临床前概念验证数据,显示该公司的作用于RNA的腺苷脱氨酶(ADAR)的RNA编辑“瞄准器”——AIMers,在非人灵长类动物模型中提供有效、持久和特定的编辑,以及在肝脏治疗应用方面的更广泛潜力。这也是ADAR介导的RNA编辑技术首次进行非人灵长类动物实验。

RNA碱基编辑是基因组编辑领域的一个十分有前途的选择。目前,一些RNA编辑工具已经被设计用于靶向腺苷-肌苷(A→I)和胞苷-尿苷(C→U)的转换。这些RNA编辑工具需要异位表达一种经过改造的编辑酶,可能造成大量的脱靶编辑。

基于此,越来越多的研究利用内源性腺苷脱氨酶(ADAR)来解决工程编辑酶的异位表达问题。据估计,人类有超过32000个致病的单核苷酸多态性(SNP),其中约50%可以通过ADAR纠正。

在这项研究中,Wave公司开发了一种简短的化学修饰的寡核苷酸——AIMers。AIMers可以作用于ADAR,包括广泛和组成性表达的ADAR1 p110亚型,从而高效和特异性地进行mRNA的A→I编辑。

AIMers的设计和优化以及靶向ACTB的编辑效率验证

根据研究人员的说法,AIMers可以在体外gymnotic条件下被几种具有高编辑效率的细胞类型所吸收,并可与GalNAc结合,这是一种已经临床验证的肝脏递送载体。在编辑效率方面,AIMers能够编辑非人灵长类动物肝脏中多达50%的β-Actin的mRNA,并且在一个多月的时间内保持高达40%的编辑水平。

Wave公司的首席技术官 Chandra Vargeese 博士表示:“我们利用化学方法将寡核苷酸简化,从而达到了高专一性的目的。自这些数据生成以来,我们一直在继续发展我们的AIMers设计,使我们能够进一步优化跨多个目标、细胞类型和组织的编辑效率,并建立多功能的治疗平台技术。”

通过AIMers和ADAR1酶在原代人肝细胞中实现多重编辑

基于全转录组分析,AIMers在体外和体内都具有高度特异性。在非人类灵长类动物的体内研究中,给药后2天,即使肝脏中AIMers水平较高时,也未发现肝脏毒性迹象。所有动物ALT和AST水平均在历史数据范围内或以下。

AIMers支持非人类灵长类动物肝脏中高达50%的β-Actin编辑水平

Wave公司设计的AIMers旨在纠正SERPINA1转录本中的Z突变——Alpha-1抗胰蛋白酶缺乏症(AATD)的最常见病因。研究结果显示,AIMers具有高水平的RNA编辑活性,这增加了体外原代肝细胞分泌的功能性alpha-1抗胰蛋白酶(AAT)蛋白的数量。

不仅如此,在转基因小鼠模型中,AIMers治疗导致大约60%的SERPINA1的mRNA的编辑,在19周时,循环AAT血清水平大约是对照组的5倍。此外,在AIMers治疗19周的转基因小鼠模型中,肝脏聚集物明显减少。这些研究结果充分证实了AIMers的安全性和有效性。

AIMers纠正SERPINA1Z转录本,增加肝细胞的AAT蛋白分泌

Wave公司的总裁兼首席执行官 Paul Bolno 博士在一份声明中说:“独特的化学修饰和创造性的设计使得AIMers的治疗应用具有巨大的潜力,这些令人信服的临床前概念证明数据让我们备受鼓舞。”

总而言之,这项研究介绍了Wave公司开发的、基于化学修饰的寡核苷酸编辑工具——AIMers,它不需要复杂的递送载体,如病毒载体或脂质纳米颗粒,就可以在肝脏、中枢神经系统(CNS)和其他组织中实现持久的编辑。

目前,Wave公司正在快速筛选首个治疗AATD患者的AIMer候选药物,并计划在今年第三季度申请临床试验。在未来的计划中,Wave公司将继续扩大AIMers在中枢神经系统和肝脏遗传病中的应用,并探索利用AIMers通过调节蛋白质相互作用来治疗非遗传疾病。

Wave公司的研发管线

正如 Paul Bolno 博士所说:RNA碱基编辑代表着精准医学的下一个前沿,而我们才刚刚开始认识到它的潜力。

论文链接:

https://www.nature.com/articles/s41587-022-01225-1

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