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2658个完整DNA序列分析——为癌症突变提供新线索
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作者:Ashley
导读:近期研究检测了来自38种不同类型肿瘤的2658个完整DNA序列,在多达21%的病例中发现了双重突变。这是一个以前在分析肿瘤时没有考虑到的观察结果,但对未来癌症研究突变的起源及其在癌症发生中的生物学意义具有重要意义。
鲁汶大学(KU Leuven)和弗朗西斯·克里克研究所(Francis Crick Institute)进行的一项大规模研究显示,21%的肿瘤存在双重突变,其中在你DNA的母系和父系拷贝中,完全相同的字母都发生了突变。这是一个以前在分析肿瘤时没有考虑到的观察结果,但对未来癌症研究突变的起源及其在癌症发生中的生物学意义具有重要意义。研究结果发表在《Nature Genetics》上,题为“Biallelic mutations in cancer genomes reveal local mutational determinants”。
我们的DNA可以被认为是一本大型食谱书,只写了4个不同的字母(A、C、G、T),但有约30亿个字符,因此,你可以将人类的DNA与大约3000本厚厚的食谱进行比较。每次一个细胞分裂,你的整个DNA都必须被拷贝过,在拷贝3000本食谱时,可能会发生笔误,这并非不可想象的事情——一个突变可以将一个细胞转变为一个癌细胞。
幸运的是,我们体内的大多数细胞都有两套食谱,一套来自我们的母亲,一套来自我们的父亲。这意味着所有的食谱仍然可以很容易地阅读,即使一个错误潜入其中。从统计学上讲,你的细胞每次分裂时在两本食谱中完全相同的字符上出错的机会是极小的。举一个例子,继续食谱的类比:番茄酱中的“balls”首先在母亲的食谱中变成番茄酱中的“bulls”,然后在父系版本中变成“bells”,反之亦然。
因为字母在你的DNA中以这种方式被扭曲的可能性是非常小的,遗传研究假设这种情况根本不会发生,我们的DNA中的字母因此只改变一次。鲁汶大学和弗朗西斯·克里克研究所的一项大规模研究现在表明,这种假设——至少对于癌细胞来说——是不正确的。
双重突变并非偶然
研究小组检测了来自38种不同类型肿瘤的2658个完整DNA序列,在多达21%的病例中发现了这些双重突变。博士后研究员Jonas Demeulemeester说:“尽管相同的字母在母系和父系拷贝中都会发生突变的概率在统计学上非常小,但它确实发生在研究的五分之一的肿瘤中。这一数字太大了,不可能是巧合。我们可以看到,例如在皮肤癌中,某些DNA片段对紫外光的损伤比其他DNA片段敏感得多,解释了一些双重突变对细胞没有重大后果。这些信息对于寻找有助于癌细胞形成的突变至关重要,因此可以成为治疗的良好靶点。”
Demeulemeester的研究小组致力于开发新的计算机算法,以便其他科学家也可以检测和研究这些双重突变。Demeulemeester总结道:“直到现在,这些双重突变一直被忽视或被认为是‘技术错误’。这就是为什么他们没有被纳入癌症遗传分析的原因。我们的研究表明,它们确实很重要,需要能够检测它们并考虑其发生的方法。”
参考资料:
https://medicalxpress.com/news/2022-02-analysis-tumors-mutations-cancer.html
注:本文旨在介绍医学研究进展,不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导,请至正规医院就诊。
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