法国检测到新冠变异新毒株B.1.640.2，有46处突变

近日，来自法国的科学家报告新冠变异新毒株B.1.640.2，其拥有46处突变。目前在法国南部已有12人被检测出感染了B.1.640.2变异毒株。 

该研究成果刊发于医学预印本网站medRxiv上，未经同行评议。研究单位为法国马赛地中海大学附属医院传染病研究所（IHU），目前他们暂时将该变异毒株命名为IHU。由于目前病例数尚不明确，其传播力、毒性、免疫逃逸能力也有待研究。

法国科学家的分析揭示了B.1.640.2拥有46个突变和37个缺失。其中，刺突蛋白（S蛋白）中有 14 个氨基酸置换，包括 N501Y 和 E484K，以及9个缺失。这种基因型模式让其成为了B.1.640.2谱系，它是旧B.1.640谱系系统发育姐妹群。两个谱系的不同之处在于25个核苷酸替换和33个缺失。

在刺突蛋白上同时含有N501Y和E484K突变之所以值得关注，因为刺突蛋白在进入人类细胞中起到了关键作用：刺突蛋白能结合人类细胞的ACE2受体 ，也是mRNA疫苗制造的主要靶标。此前研究表明，新冠病毒S蛋白若出现E484A或N501Y突变，提示免疫逃逸能力增强。 

研究人员表示，他们最早在上普罗旺斯阿尔卑斯省福卡尔基耶的一名新冠病毒感染者身上发现了该变异毒株。该患者是从喀麦隆旅行后确诊的，因此怀疑这一变异毒株可能源于非洲。 

复旦大学病原微生物研究所所长姜世勃此前接受澎湃新闻（www.thepaper.cn）采访时表示，新冠病毒作为一种RNA病毒，较易发生变异。 

根据美国病毒学家、诺贝尔生理学或医学奖得主David Baltimore提出的病毒分类，包括新冠病毒在内的冠状病毒属于正链RNA病毒，也就是说病毒的基因组RNA可以直接作为mRNA进行病毒蛋白质的翻译合成，病毒基因组先合成出负链RNA，再以其为模板合成出子代的正链基因组RNA。 

值得一提的是，病毒聚合酶（polymerase）在病毒基因组复制和转录中起核心作用，RNA病毒则利用RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）复制和转录其基因组。而RNA容易突变的原因即在于RdRp不具有核酸酶校对活性，因此其基因组在复制过程中核苷酸的错配率就比较高。

在前后两任中科院武汉病毒研究所所长胡志红、陈新文主编的《普通病毒学》一书中，病毒的突变率通常定义为在病毒的每个复制周期中，病毒子代基因组中产生核苷酸突变的平均数。他们提到，与其他生物体相比较，病毒具有很高的突变率。一般来说，RNA病毒每10^3-10^7个核苷酸中就会出现一个错误碱基，而DNA病毒突变率相对较低，没10^9-10^10个核苷酸会发生一次这样的错误。

清华大学医学院和万科公共卫生与健康学院张林琦教授此前在接受澎湃新闻（www.thepaper.cn）记者采访时表示，实际上，作为RNA（核糖核酸）病毒中的一种，人们对新冠病毒的突变无需感到惊讶，“它自己在复制过程中的复制机器就没有像人类基因复制那么准确，这是RNA病毒的一种‘天性’。”