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全国首个东佛里生绵羊高质量参考基因组发布

2021-06-23 12:15
来源:澎湃新闻·澎湃号·媒体
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6月9日,美国国家生物技术信息中心(NCBI)在线发布了来自西北农林科技大学和甘肃元生中新奶绵羊产业研究院组装完成的全国首个东佛里生绵羊高质量参考基因组,这是甘肃元生中新奶绵羊产业研究院成立以来取得的第一项重要科技成果,它在分子层面为指导“乳肉”兼用绵羊新品种的选育工作提供了重要参考,对于完善绵羊种质资源库、进一步实施种质资源保护、筛选组建绵羊核心育种群有着重要意义。

2017年,西北农林科技大学金昌奶绵羊试验示范基地依托甘肃元生农牧科技有限公司,首次从国外批量引进东佛里生羊冷冻胚胎,并进行胚胎移植,生产并扩繁纯种1000余只。2020年12月19日,西北农林科技大学、甘肃元生农牧科技有限公司联合建立甘肃元生中新奶绵羊产业研究院,利用东佛里生羊与金昌高繁湖羊进行杂交,开展“乳肉”兼用奶绵羊新品种培育工作,目前已形成全国最大的奶绵羊杂交群体。市科技局列支100万元专项补助资金,助力甘肃元生中新奶绵羊产业研究院开展奶绵羊高效繁殖、日粮配制、饲养管理、环境控制和绵羊奶精深加工等全产业链技术研发。

此次发布的全国首个东佛里生绵羊高质量参考基因组是由西北农林科技大学、甘肃元生中新奶绵羊产业研究院宋宇轩研究员团队,首次利用最新的Pacbio HiFi测序技术对东佛里生种公羊进行基因组测序组装获得的,该基因组的contig N50达到了85.1 Mb,在NCBI已公布的羊参考基因组中连续性最高。

东佛里生羊高质量参考基因组的组装能够为奶绵羊基因组学研究提供参考基因组,从而帮助研究人员进一步探究影响高泌乳量、高繁殖率和高生长速度的遗传机制,从分子层面对种羊进行直接选择,并对影响主要经济性状的基因进行有效聚合,大幅度提高育种效率,缩短育种年限,实现从传统“经验育种”到定向、高效“精准育种”的跃升。

文:记者 韩淇

部分图片来源:甘肃元生农牧科技有限公司

原标题:《全国首个东佛里生绵羊高质量参考基因组发布》

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