中国研发诊断工具可更灵敏地检测SARS-CoV-2感染

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论文精选

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一种基于CRISPR-Cas12a的特异增强技术，可更灵敏地检测SARS-CoV-2感染

由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型（SARS-CoV-2）引起的新冠肺炎，已经造成全球性大流行。rRT-PCR技术是目前COVID-19分子诊断的金标准，然而， rRT-PCR诊断的准确性经常受到Ct值过高引起的假阳性或者假阴性问题的挑战。

上海师范大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理研究所、深圳大学医学院的科学家合作建立了一种基于CRISPR的诊断技术，即PCR扩增核酸特异增强（SENA）技术，并证明SENA的每次反应LoD至少比rRT-PCR少两个拷贝。

SENA是一种安全、简单、稳定、快速、低成本的诊断工具，不需要额外的仪器。更重要的是，它可以有效地消除基于PCR的诊断的不确定性问题，因而在COVID-19诊断和许多其他临床应用中具有巨大的应用潜力。

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CUP AI Dx：一种利用RNA基因表达数据和人工智能推断癌组织来源和分子亚型的工具

未知原发性癌症（CUP）指存在转移性肿瘤，但是临床和组织病理学未能发现原发性病变的肿瘤。免疫组化检测是用来识别肿瘤的细胞角蛋白和有限数量的细胞类型特异性抗原。利用基因表达、DNA甲基化和突变分析来诊断原发性组织的检测方法提高了针对转移性肿瘤的检测能力。然而，这些测试缺乏对重要肿瘤类型分类的代表性，依赖于常规实验室不常用的专业平台，并且不能识别已经被泛癌基因组研究识别的肿瘤分子亚型。

美国和澳大利亚的学者设计了一个深度神经网络模型，利用来自两个最大的泛癌基因组联盟癌症基因组图谱（TCGA）和国际癌症基因组联合会（ICGC）的32种癌症类型的RNA序列基因表达来识别肿瘤的主要起源。作者还开发了一个机器学习分类器，一旦预测了肿瘤的主要来源，就可以识别11种癌症类型的分子亚型。该分类器可以广泛应用于具有RNA测序数据的临床样本。

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活疫苗感染负载可引起预防寨卡病毒感染所需的适应性体液和细胞免疫

针对寨卡病毒等黄病毒的疫苗研发喜忧参半，尽管已经确定了许多潜在的候选疫苗。缺乏对疫苗固有属性的了解限制了其发展，对已经被证明成功的黄热病减毒活疫苗（YF17D）的研究发现，先天免疫反应的大小以及疫苗负荷持续时长与最终的中和抗体滴度有关。然而，疫苗负载的持续时间是否在功能上决定疫苗的免疫原性和有效性仍有待确定。

来自新加坡国立大学的一项研究强调疫苗负载在开发针对寨卡病毒感染的适应性免疫反应中的关键作用。这项研究还表明，一个A129小鼠模型研究说明，成功的寨卡病毒疫苗必须诱导体液免疫和细胞免疫，以达到杀菌免疫和防止寨卡病毒传播的目的。该研究结果可以指导未来寨卡病毒和其他黄病毒疫苗的开发。

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综合多组学研究揭示了人类后代辅助生殖技术的表观遗传学风险

辅助生殖技术（assisted reproductive technologies，ART）会引起后代表观遗传异常。以往研究主要集中在ART对少量基因或重复元件的表观遗传影响。北京大学附属第三医院乔杰院士团队通过系统地分析DNA甲基体、四个全基因组组蛋白修饰和后代的转录组，揭示了不同ART程序对表观基因组产生的独特的或者普遍的影响。研究表明，ART诱导的表观遗传改变倾向于远离活跃的顺式调控元件。而且，ART产生的双胞胎其DNA甲基体的相似性降低， 证实了后代中DNA甲基组的很大比例的变化可以由他们的父母背景偏差来解释。同时，作者首次报道了ARTs对四种不同组蛋白修饰（H3K4me3、H3K4me1、H3K27me3和H3K27ac）的全基因组影响。IVF-ET几乎对两种组蛋白修饰都没有干扰。H3K4me3是ICSI和冻融过程中受影响最大的组蛋白修饰。该研究为了解ART后代长期健康风险研究提供了表观遗传学基础。

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基于白细胞介素-6和白细胞介素-10比值预测COVID-19的预后

新冠肺炎患者的循环细胞因子水平升高并快速发展为急性呼吸窘迫综合征。都柏林-波士顿评分基于白细胞介素（IL）-6与白细胞介素-10比值随时间的变化，并确定住院患者存在发生不良结局的风险。爱尔兰皇家外科学院的科学家评估了该评分及其衍生的IL-6:IL-10的变化，研究显示其明显优于单独使用IL-6的预测能力。细胞因子平衡的改变可预测临床进展，并可用于指导临床决策。对预后的预测有助于确定何时升级或降级护理，这是当前新冠肺炎大流行期间有效分配资源的关键。

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高血压与海马连接减少和记忆受损有关

高血压与记忆和认知有关。有报道称高血压患者大脑某些区域的结构改变。复旦大学和英国华威大学的科学家在一项由英国生物银行19507名参与者参与的神经影像学研究证实，高血压病史与海马体的功能连通性降低有关，还与颞下皮质、后扣带回皮质和背外侧前额叶皮质有关。海马功能连接的降低导致前瞻性记忆评分的降低。在很大的收缩压范围内，海马功能连接的降低和记忆障碍之间存在一种分级线性关系。该研究对高血压的临床治疗具有重要意义。

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脂毒性对囊性纤维化的作用

囊性纤维化（CF）是一种常染色体隐性遗传疾病，由CFTR基因突变引起，CFTR基因编码位于上皮细胞顶端表面的氯离子通道。长期观察发现CF患者组织缺乏不饱和脂肪酸（UFA）. 然而，这种缺陷对疾病病因的影响一直是争论的焦点。法国瓦捷大学（Universite de Poitiers）学者撰写综述讨论脂毒性对囊性纤维化的作用。综述首先强调人们对脂肪酸失调的普遍共识，虽然有些共识来源于明显矛盾的研究。在第二部分中，作者基于膜生物物理特性的改变（即脂肪中毒），提出了一个统一的机制来解释这些脂肪酸失调在CF细胞中的潜在影响。最后，本文还讨论了脂肪中毒对CF疾病进展的影响以及它如何影响目前治疗的疗效。END

*中文翻译仅供参考，一切内容以英文原文为准。

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